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Reaction pathway prediction

ASKCOS: an open source software suite for synthesis planning

Acc. Chem. Res.58 (11), 1764–1775 (2025)

Zhengkai Tu, Sourabh J. Choure, Mun Hong Fong, Jihye Roh, Itai Levin, Kevin Yu, Joonyoung F. Joung, Nathan Morgan, Shih-Cheng Li, Xiaoqi Sun, Huiqian Lin, Mark Murnin, Jordan P. Liles, Thomas J. Struble, Michael E. Fortunato, Mengjie Liu, William H. Green, Klavs F. Jensen, Connor W. Coley*

이 연구는 오픈소스 유기합성 설계 도구인 ASKCOS의 최신 버전을 소개하고, 단일 반응 예측부터 전체 합성 경로 평가까지 통합적으로 지원하는 모듈형 소프트웨어 플랫폼으로서의 기능과 성능을 종합적으로 정리한 것이다. ASKCOS는 총 4가지 one-step retrosynthesis 모델(template-based 및 template-free 포함)을 지원하며, 이를 기반으로 대화형(interactive) 혹은 자동화된 자동 검색 기반의 합성 경로 설계를 수행할 수 있다. 또한 반응 조건 추천, 반응 생성물 예측, 불순물 및 위치선택성(regioselectivity) 예측, 경로 평가, 용해도 및 QM descriptor 예측 등 합성 전반에 필요한 보조 기능들이 포함되어 있다. 모든 기능은 웹 기반 UI와 API 형태로 접근 가능하며, 최신 버전에서는 모듈별 containerized microservice 구조를 채택해 유지보수성과 확장성이 강화되었다. 실제 FDA 승인 신약 분자들을 대상으로 한 사례 연구에서도, 자동 경로 탐색의 성능과 한계, 그리고 인터랙티브한 경로 조정을 통한 설계 유연성을 실증하였다. 다양한 예측 모델과 검색 알고리즘(MCTS, Retro*)을 결합하여 현실적인 합성 경로를 제시할 수 있으며, open-source라는 점에서 산업 및 학계에서의 사용자 맞춤형 커스터마이징이 가능하다는 점도 강조된다. 본 연구는 CASP(computer-aided synthesis planning) 시스템이 더 넓은 화학 커뮤니티로 확산되기 위한 프리컴피티티브(Precompetitive) 오픈 플랫폼으로서의 가능성을 제시한다.

20251000_ASKCOS an open source software

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